git の hooks（pre-commit など）が動かない時に確認すること

結論

.git/config の [core] の部分に hookspath が指定されているかどうかを確認する。

具体例

git/config に以下のように書き加えます*1。

[core]
（省略）
  hookspath=.git/hooks
（以下省略）

*1:標準のディレクトリ構成の場合