まずローカルにリポジトリを作りそれから GitHub にリポジトリを作った場合にさっさと設定する

結論

すでに GitHub にはリポジトリを作っているとします。

$ git pull git@github.com:USERNAME/REPONAME.git master
$ git add .
$ git commit -m "コミットコメント"
$ git remote add origin git@github.com:USERNAME/REPONAME.git
$ git push

補足

• GitHub でなくても*1同様です
• pull に失敗する場合は stash するなどして解消しましょう
• めんどくさい場合はとっとと clone してファイルコピーした方がたぶん楽です

*1:GitLab や GitBucket などでも