結論
Graphviz (CLI) はインストール済みであるとします。
$ dot -Tpdf /path/to/hoge.dot -o /path/to/fuga.pdf
具体例
Rails ERD では dot で出力が可能なところ、その dot を PDF に変換するために有用です。
「Rails ERD で最初から PDF に出力すると Git で差分が分からない（毎回差分が出る）ので dot 運用したい」というようなケースで有効です*1。
公式ドキュメント
*1:dot の差分が分かりやすいかと言われると決してそうではないのですが
