結論
Alfred 上で reload と入力して実行する（下の画像を参照してください）。
具体的に起きた現象
Catalina にアップグレードした後に、以下の画像のように Slack の場所が /Applications/Slack.app と /System/Volumes/Data/Applications/Slack.app と二重に出てきました。
どちらを選んでも同じ場所を指しているのですが、少々気持ち悪いのと、検索結果の行数を消費してしまうために対処しました。
参考
キャッシュが原因でした。
