PicPick
Windows でスクリーンショットをローカルで撮るならば現時点ではこれ一択だと思います*1。日本語にも対応しています。
さらに内蔵の「PicPickエディター」は軽量な画像加工エディタとして、単独でも使い勝手が良いです。
「範囲を指定して塗りつぶす」
撮影したスクリーンショットに対して「範囲を指定して塗りつぶす」のにちょっとハマったのでやり方を書いておきます。
範囲を選択するために「選択」メニューを使ってはいけない
「範囲を指定して塗りつぶす」流れとしては、「範囲を選択して」→「塗りつぶす」という文字通りの流れをたどります。ただし、ここで「範囲を選択して」の箇所で「選択」というメニューを使ってはいけません*2。
「選択」メニューを使って選択してから「塗りつぶし」をしても、選択範囲への塗りつぶしとはなりません。
「図形を描く」メニューを用いる
ではどうするか。代わりに「図形を描く」メニューを用います*3。以下の場所にあるメニューです。
ここで「図形を描いて」から「塗り潰し」のメニューを選択すると、選択範囲を塗りつぶすことができます。
補足
「図形を描く」メニューを用いれば、例えば「赤い色の枠線で対象を囲う」のようなこともできます。「塗り潰し」をしないで外枠だけ色を付けるということです。